lammps 的 molecule 命令可以导入需要的分子,但是需要自己写一个含有该分子信息的 txt 文件。桃子搜集了几个可以找到很多分子各种信息的网站,纯属偶遇,可能不全面,但是总之满足桃子本人的需求了。

cactus.nci.nih.gov

https://cactus.nci.nih.gov/chemical/structure

这个网站可以通过分子的名字或者结构得到一系列有关分子的信息。


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软件 Avogadro 中可以直接输入分子的名字导入分子,就是通过这个网站实现的。


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就是这个网站有点慢,所以软件加载分子也有点随缘。


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atb.uq.edu.au

http://atb.uq.edu.au/index.py?tab=existing_molecules


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这样就可以搜到网站中存在的所有分子氧的数据:


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不过它说是可以下载 lammps 格式,其实是下载的 moltemplate 文件,然后自己转成 data 文件。


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webbook.nist.gov

https://webbook.nist.gov/chemistry/name-ser/

也可以选择按名字或者按化学式等方式搜索:


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能够得到很全面的数据,包括光谱等很多信息。


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