用delete_atoms random随机删除一些原子。但是命令中的compress yes会失效。

因为原子ID重排与分子系统(通过atom_style定义的)冲突。

用reset_atom_ids sort yes强制重排了全部ID。sort yes表示对所有处理器分配一致的ID

如果原子ID不连续,会导致velocity命令报错

大佬论坛